Activité enzymatique
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| V ou F: Les enzymes accélèrent les réactions chimiques en diminuant l'énergie libre des substrats. | Faux, il s'agit de l'abaissement de l'énergie d'activation des réactions chimiques qui accélère celles-ci |
| Les enzymes peuvent-elles contrôler la stéréospécificité des substrats et des produits ? | Oui, un exemple serait que seuls les a.a. de type L (pas D) sont utilisés lors de la synthèse protéique |
| Que veut dire " k " et que représente-il ? | Constante de vitesse et reflète la vitesse intrinsèque de la réaction chimique (soit proportion de molécules transformées par seconde) |
| Quel est la formule ( étapes) d'une réaction chimique catalysée par une enzyme ? | E + S ⇋ [ES] ⇋ [EP] → E + P 1. S (substrat) se lie à l'E (enzyme) pour former complexe ES 2. Transformation du S dans le site catalytique de l'E pour obtenir EP 3. complexe EP se décompose et relâche le P (en théorie réversible mais négligable) |
| Quel est l'équation de réaction catalytique de Michaelis-Menten? | _____k1__________k2____ E + S ⇋ [ES] ⇋ [EP] → E + P _____k-1________________ |
| Comment peut-on décrire la vitesse de la réaction de Michaelis-Menten? | V= k2 [ES] (k2 aussi appelé kcat (constante catalytique), soit le nombre de molécules de substrat transformées par chaque molécule d'enzyme par seconde) |
| V ou F: La concentration de [ES] varie au cours du temps | Faux, elle ne variera pas (bien sur dans des conditions de saturation du substrat) |
| Que veut dire Km et à quoi est-il égale? | Km est la constante de Michaelis-Menten, soit l'affinité du substrat pour l'enzyme Km = Vmax[S] / Km + [S] Km correspond également à [S] pour Vmax/2 |
| À quoi équivaut Vmax | Vmax = kcat[Eo] , soit la vitesse de réaction maximale lorsque l'Enzyme est complètement saturées par les molécules de substrat |
| Comment s'interprète le rapport Kcat/Km? | Constante de vitesse pour le réaction entre le substrat et l'enzyme libre Le rapport correspond à une mesure de l'efficacité catalytique d'une enzyme |
| À quoi ressemble le graphique de Michaelis-Menten? | Une hyperbole rectangulaire |
| À quoi sert le graphique de Lineweaver-Burke et à quoi ressemble-t-il? | C'est un dérivé de l'équation de Michaelis-Menten (1/Vo et 1/[S] ) qui permet de mesurer plus précisément les valeurs de Km et Vmax |
| Quel est l'équation de Lineweaver-Burke | Voir photo |
| Quel sont les 3 types d'inhibiteurs ? | 1. Inhibiteurs compétitifs 2. Inhibiteurs non-compétitifs 3. Inhibiteurs incompétitifs |
| Comment est représenté l'efficacité d'un inhibiteur? | Par sa constance d'inhibition Ki Plus le Ki est petit, plus l'affinité de l'inhibiteur pour l'enzyme est élevée |
| Qu'est-ce qu'un inhibiteur compétitif et quel est son effet sur le Vmax et sur le Km? | Il compétitionne directement avec le substrat pour lier le site actif de l'enzyme Vmax: inchangé Km: augmenté (de 1 + [I]/Ki ) En augmentant [I], l'E requiert une [S] plus élevée pour atteindre Vmax) |
| Qu'est-ce qu'un inhibiteur incompétitif et quel est son effet sur le Vmax et sur le Km? | Il se lie seulement au complexe [ES] et non à l'E seule Vmax & Km: diminué (de 1 + [I]/Ki' ) |
| Qu'est-ce qu'un inhibiteur non-compétitif et quel est son effet sur le Vmax et sur le Km? | Il peut se lier à l'enzyme et au complexe [ES] ***** Si Ki = Ki', alors Km est inchangé |
| Quels stratégies peuvent être utilisées afin que la vitesse soit linéaire pendant la période d'incubation et éviter une accumulation du P qui pourrait engendrer de la rétro-inhibition? | 1. Mesurer pour une courte durée la réaction enzymatique ( - accumulation) 2. Utiliser de hautes concentrations de [S] 3. Utiliser des pH non physiologiques (basique si Produit est un proton, on enlève le proton et déplace la réaction dans le sens de formation de P) 4. Utiliser des méthodes (sensibles) qui détecte le P afin de minimiser la [P] 5. Inhibition par le S à hautes [ ] ****** |
| Quels sont 3 facteurs qui peuvent influencés les valeurs de Vmax et Km? | 1. Le pH (valeurs max. de certains enzymes = très loin du pH physiologique) 2. Le tampon ou force ionique (peuvent agir comme Inhibiteurs --> compétitionnent avec des S possédant des charges négatives pour lier les site actif) 3. La température (la vitesse augmente de 2X/ augmentation de 10°C, sans trop augmenter pour ne pas dénaturer l'enzyme soit environ 25°C jusqu'à parfois 37°C, période d'incubation courte + température élevée = moins de temps pour dénaturer l'enzyme) |
| Qu'est-ce que la méthode discontinue? | Méthode qui détermine la quantité de produit généré durant la réaction L'enzyme est incubé avec ses S à différentes périodes de temps et la réaction est ensuite arrêtée L'évolution de la réaction doit être linéaire |
| Comment arrête-t-on la réaction dans la méthode discontinue? | Par une méthode qui provoque la dénaturation instantanée de l'enzyme(ex: par précipitation ou dénaturation thermique) ou déplace l'équilibre de la réaction afin que l'enzyme ne soit plus active ( ex: changement de pH) |
| Comment mesure-t-on le produit dans la méthode discontinue? | On peut: Convertir le P directement ou indirectement en un autre P plus facile à détecter Détection par spectrophotométrie ou fluorométrie ****** |